Theo Quyết định, Sở Quy hoạch - Kiến trúc Hà Nội là cơ quan chuyên môn thuộc UBND Thành phố, thực hiện chức năng tham mưu, giúp UBND Thành phố quản lý nhà nước về lĩnh vực quy hoạch đô thị và nông thôn, kiến trúc.
Sở có tư cách pháp nhân, có con dấu và tài khoản riêng; chịu sự chỉ đạo, quản lý về tổ chức, biên chế và hoạt động của UBND Thành phố, đồng thời chịu sự chỉ đạo, hướng dẫn, kiểm tra về chuyên môn, nghiệp vụ của Bộ Xây dựng. Trụ sở chính của Sở đặt tại 31B phố Tràng Thi, phường Cửa Nam.
Sở thực hiện 18 nhóm nhiệm vụ liên quan đến quy hoạch đô thị và nông thôn; kiến trúc; phát triển đô thị; Quản lý theo quy định của pháp luật đối với các doanh nghiệp, tổ chức kinh tế tập thể, kinh tế tư nhân, các hội và các tổ chức phi chính phủ; hợp tác quốc tế; tổ chức nghiên cứu, ứng dụng tiến bộ khoa học - kỹ thuật và công nghệ, đổi mới sáng tạo và chuyển đổi số...
Về cơ cấu tổ chức, Sở có 7 phòng và tương đương thuộc Sở: Văn phòng; Phòng Tổng hợp; Phòng Quy hoạch hạ tầng kỹ thuật; Phòng Quy hoạch - kiến trúc Bắc sông Hồng; Phòng Quy hoạch - kiến trúc Nam sông Hồng; Phòng Quy hoạch - kiến trúc Đô thị vệ tinh và nông thôn; Phòng Quản lý hoạt động quy hoạch, kiến trúc, đô thị. Bên cạnh đó, Sở có 01 đơn vị sự nghiệp trực thuộc là Ban Quản lý đồ án quy hoạch kiến trúc.
Biên chế công chức, số lượng người làm việc trong đơn vị sự nghiệp công lập của Sở được giao trên cơ sở vị trí việc làm, gắn với chức năng, nhiệm vụ, phạm vi hoạt động và nằm trong tổng biên chế công chức, biên chế sự nghiệp trong các cơ quan, tổ chức hành chính, đơn vị sự nghiệp công lập của Thành phố được cấp có thẩm quyền giao hoặc phê duyệt.