Theo Quyết định, Trung tâm Đăng kiểm xe cơ giới Hà Nội là đơn vị sự nghiệp công lập có thu, thực hiện chức năng kiểm định an toàn kỹ thuật và bảo vệ môi trường xe cơ giới và nghiệm thu xe cơ giới cải tạo theo quy định hiện hành của pháp luật. Trụ sở chính đặt tại Km15, quốc lộ 6, phường Yên Nghĩa, (Mã trạm: 3301S), Chi nhánh: Số 2, ngõ 550, phố Chùa Thông, phường Sơn Tây (Mã trạm: 3302S). Trung tâm có tư cách pháp nhân, con dấu và tài khoản riêng, được sử dụng thêm 01 con dấu tại Chi nhánh Sơn Tây để phục vụ công tác chuyên môn.
Trung tâm là đơn vị sự nghiệp có thu, tự đảm bảo toàn bộ chi phí hoạt động thường xuyên, có con dấu và tài khoản riêng để hoạt động theo quy định của pháp luật; chấp hành sự chỉ đạo, quản lý trực tiếp về tổ chức, biên chế và hoạt động của Sở Xây dựng thành phố Hà Nội, đồng thời chịu sự chỉ đạo, hướng dẫn về chuyên môn, nghiệp vụ của Cục Đăng kiểm Việt Nam.
UBND Thành phố giao Trung tâm thực hiện 08 nhiệm vụ, quyền hạn chính: Kiểm định xe cơ giới theo quy trình, tiêu chuẩn của Bộ Xây dựng và Cục Đăng kiểm Việt Nam; Cấp giấy chứng nhận đạt chuẩn an toàn kỹ thuật và môi trường; Giám định kỹ thuật xe khi có tai nạn hoặc theo yêu cầu cơ quan chức năng; Bảo quản, sửa chữa thiết bị kiểm định; Bồi dưỡng nghiệp vụ cho viên chức; Có Trạm dịch vụ kỹ thuật xe cơ giới trực thuộc, hoạt động kinh tế độc lập; Quản lý tài chính, tài sản, cán bộ theo quy định pháp luật; Thực hiện nhiệm vụ khác theo phân công của Giám đốc Sở Xây dựng.
Cơ cấu tổ chức gồm 01 Giám đốc và không quá 03 Phó Giám đốc; 05 phòng, đội chuyên môn. Biên chế được giao căn cứ theo vị trí việc làm, chức năng và nằm trong tổng biên chế sự nghiệp Sở Xây dựng. Hoạt động theo cơ chế tự chủ tài chính toàn phần theo Nghị định 60/2021/NĐ-CP của Chính phủ.