Theo đó, một trong những nhiệm vụ trọng tâm được thành phố chỉ đạo khá quyết liệt là thắt chặt quy chuẩn nước thải nhằm quản lý và kiểm soát nước thải phát sinh từ hoạt động sản xuất công nghiệp. UBND thành phố xây dựng các quy chuẩn kỹ thuật môi trường về chất thải nghiêm ngặt hơn so với cả nước và đề nghị Bộ Tài nguyên và Môi trường ban hành áp dụng trên địa bàn Thủ đô. Trong đó có 3/5 quy chuẩn được ban hành theo quy định tại Thông tư số 51/2014/TT-BTNMT ngày 5/9/2014 liên quan đến quy định về xả nước thải vào nguồn nước.

Để tăng cường kiểm soát ô nhiễm môi trường nước, UBND thành phố đã phê duyệt quy hoạch mạng lưới quan trắc tài nguyên nước trên địa bàn thành phố. Theo quy hoạch, đến hết năm 2020, mạng lưới quan trắc tài nguyên nước sẽ đạt 149 điểm gồm 256 công trình quan trắc, trong đó: 21 điểm tương ứng 21 công trình quan trắc tài nguyên nước mặt, 128 điểm bố trí 235 công trình quan trắc nước dưới đất.  

UBND thành phố cũng đã giao Sở Tài nguyên và Môi trường xây dựng đề án nâng cao năng lực quan trắc môi trường trên địa bàn thành phố; tiến hành rà soát, đánh giá hệ thống quan trắc tài nguyên nước hiện có, tiến tới hoàn thiện hệ thống quan trắc tài nguyên nước trên địa bàn thành phố. Theo kết quả rà soát, đã đề xuất đến hết năm 2020 cần tiến hành đầu tư lắp đặt mới 6 trạm quan trắc nước mặt tự động trên sông Hồng, sông Đuống, sông Cầu Bây và Hồ Tây; bên cạnh 2 trạm quan trắc nước mặt hiện có trên sông Nhuệ và sông Đáy; hoàn thiện hệ thống quan trắc nước mặt định kỳ với 70 điểm quan trắc trên sông, hồ, ao chính; 25 điểm quan trắc nước thải khu đô thị; 80 điểm quan trắc nước thải bệnh viện; 80 điểm quan trắc cửa xả nước thải vào các lưu vực sông; 22 điểm quan trắc nước thải khu công nghiệp, cụm công nghiệp; 22 điểm quan trắc nước thải làng nghề.

Ngoài ra, sở, ngành liên quan của thành phố đề xuất các trạm xử lý nước thải đô thị có công suất xử lý hơn 10.000m3/ngày đêm, các khu công nghiệp, cụm công nghiệp, cơ sở sản xuất có lưu lượng nước thải phát sinh hơn 1.000m3/ngày đêm phải lắp đặt hệ thống quan trắc nước thải tự động truyền dữ liệu trực tiếp về Sở Tài nguyên và Môi trường nhằm tăng cường kiểm soát chất lượng nguồn nước, cảnh báo sớm ô nhiễm môi trường nước.