Theo đó, thành lập Trường Trung học phổ thông Phúc Thịnh thuộc Sở Giáo dục và Đào tạo. Trường có trụ sở tại xã Phúc Thịnh, thành phố Hà Nội.
Trường Trung học phổ thông Phúc Thịnh là cơ sở giáo dục phổ thông công lập trong hệ thống giáo dục quốc dân và trong hệ thống các trường phổ thông của thành phố Hà Nội; có tư cách pháp nhân, được sử dụng con dấu riêng và mở tài khoản tại Kho bạc Nhà nước, ngân hàng thương mại theo quy định của pháp luật.
Trường Trung học phổ thông Phúc Thịnh được tổ chức và hoạt động tuân thủ các quy định hiện hành của Bộ Giáo dục và Đào tạo đối với trường trung học phổ thông; Trường chịu sự chỉ đạo, quản lý trực tiếp, toàn diện theo quy định của Sở Giáo dục và Đào tạo và các cơ quan khác có liên quan của thành phố Hà Nội.
Biên chế sự nghiệp của Trường Trung học phổ thông Phúc Thịnh được xác định theo quy định tại Thông tư số 20/2023/TT-BGDĐT ngày 30/10/2023 của Bộ Giáo dục và Đào tạo, trong tổng biên chế sự nghiệp của Sở Giáo dục và Đào tạo, được UBND Thành phố phân bổ hằng năm.
Đối với năm học 2025 – 2026, Sở Giáo dục và Đào tạo điều chỉnh trong tổng số biên chế sự nghiệp được giao năm 2025 để bố trí 42 biên chế viên chức, 05 chỉ tiêu lao động hợp đồng theo Nghị định số 111/2022/NĐ-CP làm bảo vệ, phục vụ cho Trường Trung học phổ thông Phúc Thịnh nhằm đáp ứng yêu cầu nhiệm vụ quản lý và đào tạo của Trường trong năm học này.