Để chủ động phòng chống thiên tai năm 2017, Huyện đã thành lập Ban chỉ huy, các Tiểu ban phòng chống thiên tai năm 2017 và phân công nhiệm vụ cụ thể cho các thành viên, chỉ đạo các xã, thị trấn chủ động xây dựng phương án phòng chống thiên tai năm 2017. Đến nay, 100% các xã, thị trấn và các đơn vị trên địa bàn huyện đã hoàn thành xây dựng phương án phòng chống thiên tai năm 2017.

Cùng với đó, huyện chủ động thành lập 5 cụm phòng tránh thiên tai, trong đó, Cụm 1 gồm 7 xã phía Bắc tổ chức tại xã An Mỹ do Chủ tịch UBND huyện Mỹ Đức Nguyễn Văn Hoạt làm cụm trưởng; Cụm 2 gồm xã Hồng Sơn, Tuy Lai, Hợp Tiến và Công ty Cổ phần Dịch vụ thủy sản Quan Sơn do ông Bùi Văn Học, Ủy viên BTV Huyện ủy - Chỉ huy trưởng Ban Chỉ huy Quân sự huyện Mỹ Đức làm cụm trưởng; Cụm 3 gồm 4 xã Lê Thanh, Xuy Xá, Phùng Xá, Phù Lưu Tế do Phó Chủ tịch UBND huyện Nguyễn Văn Hậu làm cụm trưởng; Cụm 4 gồm các xã Hợp Thanh, An Tiến, Thị trấn Đại Nghĩa, An Phú do Phó Chủ tịch UBND huyện Đặng Văn Triều làm cụm trưởng; Cụm 5 gồm các xã Đốc Tín, Đại Hưng, Vạn Kim, Hùng Tiến, Hương Sơn do Đại Tá Lê Xuân Văn, Ủy viên BTV Huyện ủy - Trưởng Công an huyện làm cụm trưởng.