Qua rà soát, huyện Phúc Thọ có: Tổng đàn lợn ước 97.300 con, gia cầm 900.000 con, trâu và bò 7.628 con; diện tích nuôi trồng thuỷ sản 673ha; có trên 700 trang trại, trang trại nuôi lợn quy mô lớn... Nhìn chung, chăn nuôi của huyện hiện nay còn nhỏ lẻ, manh mún và chăn nuôi trong khu dân cư; chăn nuôi chưa tập trung thành vùng, xã trọng điểm; người chăn nuôi thiếu vốn đầu tư, giá cả thị trường không ổn định vì vậy người chăn nuôi chưa yên tâm đầu tư sản xuất theo quy mô lớn.
Hiện nay, vấn đề an toàn thực phẩm đang là mối quan tâm hàng đầu của các ngành, các cấp, các địa phương. Căn cứ tình hình thực tế phát triển chăn nuôi của huyện những năm gần đây có sự phát triển mạnh mẽ về quy mô, số lượng tổng đàn gia súc, gia cầm ngày càng tăng. Theo Quyết định số 5791/QĐ-UBND ngày 12/12/2012 của UBND thành phố về phê duyệt quy hoạch hệ thống cơ sở giết mổ và chế biến gia súc, gia cầm tập trung trên địa bàn thành phố, huyện Phúc Thọ được quy hoạch 2 cơ sở giết mổ gia súc, gia cầm tập trung tại 2 xã: Tam Hiệp, Võng Xuyên. Tuy nhiên chưa được thi công, nên đến nay toàn huyện chưa có điểm giết mổ tập trung.
Nhằm từng bước hạn chế và dần xóa bỏ hình thức giết mổ nhỏ lẻ tại hộ gia đình không đảm bảo vệ sinh thú y, huyện Phúc Thọ đề xuất thành phố giữ nguyên 2 điểm giết mổ tập trung nêu trên, đồng thời, bổ sung 9 khu giết mổ tập trung tại các xã có chợ (Thọ Lộc, Sen Chiểu, Vân Phúc, Hát Môn, Long Xuyên, Phụng Thượng, Ngọc Tảo, Hiệp Thuận, thị trấn Phúc Thọ).
