Theo đó, phân cấp quản lý cơ sở sản xuất, chế biến, kinh doanh thực phẩm, kinh doanh dịch vụ ăn uống giữa cấp thành phố, cấp huyện theo nguyên tắc cấp nào cấp Giấy chứng nhận đăng ký kinh doanh, Giấy chứng nhận, đăng ký đầu tư về sản xuất, kinh doanh thực phẩm thì cấp đó quản lý cơ sở (trừ các trường hợp: Cơ sở theo phân cấp tuyến trung ương quản lý; hợp tác xã sản xuất, kinh doanh sản phẩm thực phẩm thuộc lĩnh vực ngành Công Thương quản lý). Đối với các cơ sở không có đăng ký kinh doanh do UBND cấp xã quản lý.

UBND cấp huyện có trách nhiệm quản lý, tiếp nhận bản tự công bố sản phẩm, xác nhận kiến thức về ATTP, tuyên truyền phổ biến kiến thức, thanh kiểm tra, hậu kiểm, giám sát, kiểm nghiệm, xử lý vi phạm, truy xuất nguồn gốc sản phẩm thực phẩm đối với cơ sở sản xuất, kinh doanh thực phẩm lĩnh vực Công Thương thuộc phạm vi quản lý của UBND cấp huyện theo quy định.

Các cơ sở sản xuất, kinh doanh thực phẩm lĩnh vực Công Thương thuộc phạm vi quản lý của UBND cấp huyện: Cơ sở sản xuất, kinh doanh các sản phẩm thực phẩm bia, rượu, cồn và đồ uống có cồn (không bao gồm sản phẩm rượu bổ do ngành Y tế quản lý); dụng cụ, vật liệu bao gói, chứa đựng thực phẩm trong quá trình sản xuất, chế biến, kinh doanh thực phẩm thuộc lĩnh vực được phân công quản lý…

Cơ sở sản xuất nhiều loại sản phẩm thực phẩm thuộc thẩm quyền quản lý của từ 2 cơ quan quản lý chuyên ngành trở lên có sản phẩm thuộc ngành Công Thương quản lý có sản lượng lớn nhất. Cơ sở không thực hiện công đoạn sản xuất nhưng kinh doanh hỗn hợp nhiều loại sản phẩm thực phẩm thuộc thẩm quyền quản lý của từ 2 cơ quan quản lý chuyên ngành trở lên. Cơ sở vừa sản xuất vừa kinh doanh nhiều loại sản phẩm thuộc thẩm quyền quản lý của từ 2 cơ quan quản lý chuyên ngành trở lên tự chọn ngành Công Thương quản lý.

UBND các quận, huyện, thị xã gửi báo cáo kết quả triển khai thực hiện công tác quản lý nhà nước về ATTP lĩnh vực Công Thương định kỳ trước ngày 15 tháng cuối cùng của quý về Sở Công Thương để tổng hợp, báo cáo UBND thành phố.